Após o registro, a denúncia é analisada pelo órgão competente — geralmente o Ministério Público ou a polícia civil. Nessa fase inicial, os promotores avaliam se há indícios mínimos para abertura de procedimento investigativo.
Se considerados suficientes, pode ser instaurado um inquérito civil ou criminal, com coleta de documentos, depoimentos e cruzamento de informações. Em casos mais complexos, a investigação pode envolver perícias, inclusive exames de DNA.
O andamento varia conforme o estado e o tipo de caso. Canais como o Ministério Público Federal e ouvidorias estaduais permitem acompanhar etapas, ainda que investigações possam tramitar sob sigilo.